10月18日，上海软科发布了2016年中国两岸四地大学排名，清华大学(北京)蝉联两岸四地第一名，北京大学跃升至第二名，排名第三的是中国台湾的清华大学(新竹)，中国科学技术大学位列第四，香港大学和香港中文大学并列第五名。澳门地区排名最高的澳门科技大学名列两岸四地第32名。
2016年软科中国两岸四地大学排名十强
2016年排名 2015排名 中文校名 地区
1 1 清华大学（北京） 大陆
2 4 北京大学 大陆
3 2 清华大学（新竹） 台湾
4 8 中国科学技术大学 大陆
5 6 香港大学 香港
5 5 香港中文大学 香港
7 3 台湾大学 台湾
8 13 香港城市大学 香港
9 9 浙江大学 大陆
10 12 上海交通大学 大陆
10 7 香港科技大学 香港
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